Izbrane teme sodobne fizike in matematike

Uporabe metode glavnih komponent pri klasifikaciji tumorjev

Članek opisuje možnost uporabe metode glavnih komponent kot pomoč pri klasifikaciji tumorjev. Najprej predstavi problem diagnoze tumorjev in matematične osnove o sami metodi glavnih komponent. Sledi poglavje o uporabi metode za klasifikacijo tumorskih celicnih linij na dejanskem primeru, ki navaja tudi prednosti in slabosti analizne metode v danem kontekstu. Članek se zaključi z osnovnim primerom uporabe PCA na izbranem podatkovju, ki preveri in podkrepi učinkovitost metode.

Use of principal component analysis for tumour classification

The article describes one of the various possibilities of using principal component analysis - PCA in biotechnological context. Firstly there is a short presentation of PCA method in more general terms, followed up with presentation of a research that actually applied PCA for tumour analysis based on data collected from cancer cell lines. At the end of the article there is a simple hand-on implementation of the pca in famous iris dataset. The implementation highlights the usefulness of the PCA.